Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP3O14828 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP3O14828 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP3O14828 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms