Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F3O00716 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F3O00716 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F3O00716 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F3O00716 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F3O00716 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F3O00716 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F3O00716 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2F3O00716 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F3O00716 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F3O00716 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F3O00716 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2F3O00716 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F3O00716 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2F3O00716 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F3O00716 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F3O00716 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F3O00716 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F3O00716 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2F3O00716 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F3O00716 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F3O00716 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F3O00716 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms