Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL22O00626 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL22O00626 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL22O00626 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL22O00626 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL22O00626 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL22O00626 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL22O00626 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL22O00626 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL22O00626 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL22O00626 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL22O00626 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL22O00626 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL22O00626 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL22O00626 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL22O00626 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms