Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXLO00592 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXLO00592 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXLO00592 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXLO00592 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXLO00592 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXLO00592 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXLO00592 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXLO00592 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXLO00592 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXLO00592 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXLO00592 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PODXLO00592 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PODXLO00592 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXLO00592 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXLO00592 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXLO00592 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXLO00592 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXLO00592 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXLO00592 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXLO00592 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXLO00592 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXLO00592 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXLO00592 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXLO00592 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXLO00592 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXLO00592 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXLO00592 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXLO00592 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXLO00592 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXLO00592 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXLO00592 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXLO00592 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXLO00592 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXLO00592 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXLO00592 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms