Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GFRA2O00451 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GFRA2O00451 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFRA2O00451 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms