Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CDO00329 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CDO00329 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CDO00329 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms