Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX16-NPEPL1H3BU86 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX16-NPEPL1H3BU86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms