Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms