Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQ06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQ06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQ06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQ06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQ06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQ06 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQ06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQ06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQ06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQ06 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQ06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQ06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQ06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQ06 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQ06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQ06 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQ06 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQ06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQ06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQ06 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQ06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQ06 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQ06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQ06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQ06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQ06 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQ06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQ06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQ06 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQ06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQ06 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQ06 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQ06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQ06 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQ06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQ06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQ06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQ06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQ06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQ06 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQ06 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQ06 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQ06 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQ06 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQ06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQ06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQ06 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQ06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQ06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQ06 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQ06 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQ06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQ06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms