Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BMQ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BMQ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BMQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BMQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BMQ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BMQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BMQ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BMQ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BMQ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BMQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BMQ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BMQ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3BMQ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3BMQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3BMQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3BMQ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3BMQ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3BMQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3BMQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3BMQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3BMQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H3BMQ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms