Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
F8VRH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F8VRH5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F8VRH5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F8VRH5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F8VRH5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
F8VRH5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
F8VRH5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F8VRH5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F8VRH5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F8VRH5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F8VRH5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F8VRH5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F8VRH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms