Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms