Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms