Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM49D1C9J1S8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM49D1C9J1S8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49D1C9J1S8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms