Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3BA8MYP8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3BA8MYP8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3BA8MYP8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms