Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8B2A6NJW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms