Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP5A6NIR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP5A6NIR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms