Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC154A6NI56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms