Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN8A6NHC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN8A6NHC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN8A6NHC0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms