Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01546A6NGU7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01546A6NGU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01546A6NGU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms