Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms