Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35F4A4IF30 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35F4A4IF30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35F4A4IF30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms