Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRD1A4D1F6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRD1A4D1F6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRD1A4D1F6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms