Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC162PA2VCL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC162PA2VCL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC162PA2VCL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms