Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC144AA2RUR9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC144AA2RUR9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC144AA2RUR9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC144AA2RUR9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC144AA2RUR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms