Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN11A1L157 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN11A1L157 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN11A1L157 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms