Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E2F8A0AVK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F8A0AVK6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms