Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YY10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0J9YY10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YY10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms