Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J235

TRAV13-2, T-cell receptor alpha variable 13-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV13-2A0A0B4J235 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV13-2A0A0B4J235 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAV13-2A0A0B4J235 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms