Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA4Q9Y5G9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGA4Q9Y5G9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGA4Q9Y5G9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGA4Q9Y5G9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGA4Q9Y5G9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHGA4Q9Y5G9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA4Q9Y5G9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA4Q9Y5G9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHGA4Q9Y5G9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHGA4Q9Y5G9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHGA4Q9Y5G9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHGA4Q9Y5G9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHGA4Q9Y5G9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHGA4Q9Y5G9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHGA4Q9Y5G9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGA4Q9Y5G9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGA4Q9Y5G9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGA4Q9Y5G9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHGA4Q9Y5G9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHGA4Q9Y5G9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHGA4Q9Y5G9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHGA4Q9Y5G9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHGA4Q9Y5G9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHGA4Q9Y5G9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHGA4Q9Y5G9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHGA4Q9Y5G9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHGA4Q9Y5G9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHGA4Q9Y5G9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGA4Q9Y5G9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGA4Q9Y5G9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHGA4Q9Y5G9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHGA4Q9Y5G9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHGA4Q9Y5G9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGA4Q9Y5G9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHGA4Q9Y5G9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHGA4Q9Y5G9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms