Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 45.1
NOL12Q9UGY1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.935e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.565e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 DHX34-202ENST00000460681 1838 ntTSL 520.38■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 COL4A5-203ENST00000470339 782 ntTSL 315.66■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-211ENST00000443302 2724 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 COL2A1-209ENST00000546974 703 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-204ENST00000357988 6024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-205ENST00000396282 3344 ntTSL 511.57□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 ABCA7-211ENST00000529442 520 ntTSL 410.39□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 PHF8-218ENST00000494928 432 ntTSL 25.52□□□□□ -1.535e-7■■■■■ 42.9
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 510.35□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 39.3
NOL12Q9UGY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 220.72■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 219.6■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-202ENST00000561711 644 ntTSL 319.2■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-221ENST00000569358 1273 ntTSL 518.17■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 517.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-208ENST00000554801 579 ntTSL 416.54■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-201ENST00000216481 3045 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-203ENST00000471734 913 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-206ENST00000487738 1076 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RHOT2-213ENST00000565004 1014 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 513.15□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 512.96□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 512.64□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 310.09□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.02□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 55.23□□□□□ -1.571e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 24.24□□□□□ -1.731e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 34.22□□□□□ -1.731e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.631e-11■■■■■ 38.7
NOL12Q9UGY1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 36.7
NOL12Q9UGY1 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 214.91□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 37.25□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 36.5
NOL12Q9UGY1 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 34.4
NOL12Q9UGY1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.137e-11■■■■■ 33.9
NOL12Q9UGY1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-11■■■■■ 33.9
NOL12Q9UGY1 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.44□□□□□ -0.97e-11■■■■■ 33.9
NOL12Q9UGY1 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 33.9
NOL12Q9UGY1 RECQL4-202ENST00000524998 686 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 33
NOL12Q9UGY1 RECQL4-207ENST00000534538 725 ntTSL 316.33■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 33
NOL12Q9UGY1 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 526.09■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 32.7
NOL12Q9UGY1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 32.7
NOL12Q9UGY1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 32.7
NOL12Q9UGY1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 32.7
NOL12Q9UGY1 CHAF1A-205ENST00000587580 494 ntTSL 322■■□□□ 1.111e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 CHAF1A-203ENST00000585854 499 ntTSL 217.75■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 RNF128-203ENST00000418562 839 ntTSL 57.1□□□□□ -1.271e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.721e-9■■■■■ 32.2
NOL12Q9UGY1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-209ENST00000600310 750 ntTSL 418.88■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-206ENST00000598471 582 ntTSL 315.87■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-211ENST00000600868 580 ntTSL 314.42□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-205ENST00000598209 551 ntTSL 413.11□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 UPF1-208ENST00000600012 501 ntTSL 512.99□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 32.1
NOL12Q9UGY1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-9■■■■■ 32
NOL12Q9UGY1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.634e-9■■■■■ 32
NOL12Q9UGY1 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 31.9
NOL12Q9UGY1 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 31.9
NOL12Q9UGY1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 27.5 ms