Protein–RNA interactions for Protein: Q9P287

BCCIP, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCCIPQ9P287 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 34
BCCIPQ9P287 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.38e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.288e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.59■□□□□ 0.258e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.498e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.73□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 59.44□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 33.8
BCCIPQ9P287 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-10■■■■■ 33.5
BCCIPQ9P287 WDR35-203ENST00000414212 3483 ntTSL 56.45□□□□□ -1.382e-10■■■■■ 33.5
BCCIPQ9P287 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.532e-10■■■■■ 33.5
BCCIPQ9P287 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-10■■■■■ 32.8
BCCIPQ9P287 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.064e-10■■■■■ 32.8
BCCIPQ9P287 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 55.98□□□□□ -1.454e-10■■■■■ 32.8
BCCIPQ9P287 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 32.2
BCCIPQ9P287 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 30.9
BCCIPQ9P287 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 30.9
BCCIPQ9P287 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.69□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 30.9
BCCIPQ9P287 MAN1B1-211ENST00000540391 3940 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 30.8
BCCIPQ9P287 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.3
BCCIPQ9P287 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 30.3
BCCIPQ9P287 NF1-215ENST00000493220 5691 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 30.3
BCCIPQ9P287 NF1-205ENST00000456735 7787 ntTSL 56.63□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 30.3
BCCIPQ9P287 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 30.3
BCCIPQ9P287 NELFA-210ENST00000455762 1022 ntTSL 519.74■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 219.36■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-207ENST00000431323 888 ntTSL 516.11■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-206ENST00000421397 574 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-208ENST00000443203 553 ntTSL 414.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 NELFA-204ENST00000411649 561 ntTSL 412.5□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 SRPK2-215ENST00000493638 715 ntTSL 33.6□□□□□ -1.832e-9■■■■■ 30.2
BCCIPQ9P287 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 29.6
BCCIPQ9P287 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 216.91■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 29.4
BCCIPQ9P287 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.321e-8■■■■■ 28.3
BCCIPQ9P287 AUH-205ENST00000478465 751 ntTSL 321.79■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 28.3
BCCIPQ9P287 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 28.3
BCCIPQ9P287 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 56.43□□□□□ -1.388e-7■■■■■ 28.3
BCCIPQ9P287 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 28.3
BCCIPQ9P287 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 28.2
BCCIPQ9P287 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 217.52■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 28.2
BCCIPQ9P287 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 28.2
BCCIPQ9P287 MAN1B1-213ENST00000544448 2090 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 28.2
BCCIPQ9P287 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 27.7
BCCIPQ9P287 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 27.7
BCCIPQ9P287 MTAP-206ENST00000577563 339 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.652e-8■■■■■ 27.7
BCCIPQ9P287 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 27.3
BCCIPQ9P287 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 27.3
BCCIPQ9P287 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 59.09□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 27.3
BCCIPQ9P287 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 27.3
BCCIPQ9P287 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 27.3
BCCIPQ9P287 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.3□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 23.13□□□□□ -1.912e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 42.12□□□□□ -2.072e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 42.11□□□□□ -2.072e-6■■■■■ 27.2
BCCIPQ9P287 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 213.73□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 410.84□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.58□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 27.91□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 27
BCCIPQ9P287 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 26.8
BCCIPQ9P287 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 26.8
BCCIPQ9P287 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 26.8
BCCIPQ9P287 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 34.02□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 26.8
BCCIPQ9P287 GLRX3-203ENST00000481034 1921 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.083e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 319.79■□□□□ 0.763e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.023e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 ZNF236-203ENST00000543926 8206 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.443e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.533e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 GLRX3-206ENST00000619341 496 ntTSL 28.45□□□□□ -1.063e-8■■■■□ 26.4
BCCIPQ9P287 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.426e-7■■■■□ 26.3
BCCIPQ9P287 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 314.76□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 26.3
BCCIPQ9P287 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 413.04□□□□□ -0.326e-7■■■■□ 26.3
BCCIPQ9P287 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 312.2□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 26.3
BCCIPQ9P287 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 210.84□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 26.3
BCCIPQ9P287 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 25.8
BCCIPQ9P287 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 25.8
BCCIPQ9P287 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 25.8
BCCIPQ9P287 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 25.5
BCCIPQ9P287 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 25.5
BCCIPQ9P287 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 25.5
BCCIPQ9P287 NSL1-206ENST00000626725 790 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 25.5
BCCIPQ9P287 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.821e-7■■■■□ 25.4
BCCIPQ9P287 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 25.4
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