Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1C1Q9NYB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO1C1Q9NYB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO1C1Q9NYB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO1C1Q9NYB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO1C1Q9NYB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO1C1Q9NYB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO1C1Q9NYB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO1C1Q9NYB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO1C1Q9NYB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1C1Q9NYB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO1C1Q9NYB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1C1Q9NYB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO1C1Q9NYB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO1C1Q9NYB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1C1Q9NYB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1C1Q9NYB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO1C1Q9NYB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO1C1Q9NYB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO1C1Q9NYB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLCO1C1Q9NYB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO1C1Q9NYB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLCO1C1Q9NYB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLCO1C1Q9NYB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO1C1Q9NYB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO1C1Q9NYB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO1C1Q9NYB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLCO1C1Q9NYB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO1C1Q9NYB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO1C1Q9NYB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1C1Q9NYB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms