Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.369e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 TRIM27-207ENST00000498117 728 ntTSL 312.96□□□□□ -0.339e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.519e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 TRIM27-206ENST00000496091 687 ntTSL 36.29□□□□□ -1.49e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.899e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 CDK11B-202ENST00000341028 881 ntTSL 223.33■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-206ENST00000615951 2227 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.798e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-205ENST00000611150 2350 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 41.1
SLTMQ9NWH9 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 318.92■□□□□ 0.628e-10■■■■■ 40.7
SLTMQ9NWH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 40.4
SLTMQ9NWH9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 40.4
SLTMQ9NWH9 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 40.4
SLTMQ9NWH9 TSC22D1-208ENST00000493016 690 ntTSL 416.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 40.3
SLTMQ9NWH9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 40.3
SLTMQ9NWH9 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 40.3
SLTMQ9NWH9 BRF1-217ENST00000550375 1362 ntTSL 317.89■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 40.3
SLTMQ9NWH9 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 426.82■■□□□ 1.887e-11■■■■■ 40.1
SLTMQ9NWH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.427e-11■■■■■ 40.1
SLTMQ9NWH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.147e-11■■■■■ 40.1
SLTMQ9NWH9 IKBKG-201ENST00000413620 892 ntTSL 521.21■□□□□ 0.997e-11■■■■■ 40.1
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.336e-10■■■■■ 39.8
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 39.7
SLTMQ9NWH9 FCGR2C-203ENST00000467903 1101 ntTSL 314.42□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 39.6
SLTMQ9NWH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.468e-8■■■■■ 39.5
SLTMQ9NWH9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.378e-8■■■■■ 39.5
SLTMQ9NWH9 ZNF503-AS2-203ENST00000484411 1125 ntTSL 1 (best)23.13■■□□□ 1.298e-8■■■■■ 39.5
SLTMQ9NWH9 ZNF503-AS2-205ENST00000491557 1006 ntTSL 221.85■■□□□ 1.098e-8■■■■■ 39.5
SLTMQ9NWH9 ZNF503-AS2-204ENST00000486015 628 ntTSL 317.89■□□□□ 0.458e-8■■■■■ 39.5
SLTMQ9NWH9 BRF1-216ENST00000550208 1040 ntTSL 323.42■■□□□ 1.349e-7■■■■■ 39.4
SLTMQ9NWH9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 39.2
SLTMQ9NWH9 BRF1-220ENST00000552127 778 ntTSL 415.92■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 39.2
SLTMQ9NWH9 JRK-208ENST00000591357 571 ntTSL 421.98■■□□□ 1.112e-10■■■■■ 38.9
SLTMQ9NWH9 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.7□□□□□ -1.52e-10■■■■■ 38.9
SLTMQ9NWH9 SOBP-202ENST00000477448 1535 ntTSL 526.85■■□□□ 1.894e-8■■■■■ 38.6
SLTMQ9NWH9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 38.6
SLTMQ9NWH9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.334e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 49.36□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 39.36□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 59.01□□□□□ -0.974e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 28.7□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.184e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.244e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.354e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.64e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.614e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.764e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.794e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.84e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.84e-10■■■■■ 38.4
SLTMQ9NWH9 RHBDF2-202ENST00000585701 572 ntTSL 414.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 38.3
SLTMQ9NWH9 RHBDF2-210ENST00000591192 554 ntTSL 411.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 38.3
SLTMQ9NWH9 RHBDF2-205ENST00000589526 629 ntTSL 211.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 38.3
SLTMQ9NWH9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-207ENST00000550056 531 ntTSL 416.61■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 215.05■□□□□ -04e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 313.46□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 212.9□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-203ENST00000546925 569 ntTSL 412.26□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 212.22□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 212□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 511.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HMGA2-209ENST00000539662 485 ntTSL 311.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 28.48□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 28.41□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HIBCH-209ENST00000416732 502 ntTSL 26.3□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 HIBCH-205ENST00000409820 511 ntTSL 35.98□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 38.1
SLTMQ9NWH9 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 37.7
Retrieved 100 of 8,230 protein–RNA pairs in 343.8 ms