Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.841e-42■■■■■ 160.8
DROSHAQ9NRR4 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-42■■■■■ 160.8
DROSHAQ9NRR4 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 221.91■■□□□ 1.11e-58■■■■■ 157.7
DROSHAQ9NRR4 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 154.6
DROSHAQ9NRR4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.588e-15■■■■■ 154.5
DROSHAQ9NRR4 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 346.6■■■■■ 5.053e-7■■■■■ 153.6
DROSHAQ9NRR4 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 320.97■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 153.6
DROSHAQ9NRR4 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.186e-20■■■■■ 152.8
DROSHAQ9NRR4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.788e-15■■■■■ 152.6
DROSHAQ9NRR4 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 324.87■■□□□ 1.578e-15■■■■■ 152.6
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 324.79■■□□□ 1.563e-21■■■■■ 148.6
DROSHAQ9NRR4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.929e-7■■■■■ 147.6
DROSHAQ9NRR4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 147.6
DROSHAQ9NRR4 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 147.6
DROSHAQ9NRR4 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 147.6
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.333e-7■■■■■ 146.3
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.372e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.182e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.152e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 22e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 226.54■■□□□ 1.842e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 225.38■■□□□ 1.652e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 325.19■■□□□ 1.622e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 225.07■■□□□ 1.62e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 322.25■■□□□ 1.152e-10■■■■■ 145.4
DROSHAQ9NRR4 MCM7-212ENST00000493352 533 ntTSL 219.91■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 145.1
DROSHAQ9NRR4 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 145.1
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 331.74■■■□□ 2.676e-11■■■■■ 142.6
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.946e-11■■■■■ 142.6
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.916e-11■■■■■ 142.6
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.646e-11■■■■■ 142.6
DROSHAQ9NRR4 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 518.86■□□□□ 0.616e-11■■■■■ 142.6
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-206ENST00000473405 783 ntTSL 1 (best)29.33■■■□□ 2.293e-7■■■■■ 140.8
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 140.8
DROSHAQ9NRR4 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 139.7
DROSHAQ9NRR4 SYN3-207ENST00000462268 488 ntTSL 313.52□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 139.7
DROSHAQ9NRR4 PACS2-207ENST00000548265 402 ntTSL 223.4■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 139.3
DROSHAQ9NRR4 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.655e-34■■■■■ 135.7
DROSHAQ9NRR4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 135.7
DROSHAQ9NRR4 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 223.29■■□□□ 1.321e-8■■■■■ 135.7
DROSHAQ9NRR4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-21■■■■■ 135.5
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.273e-7■■■■■ 135.2
DROSHAQ9NRR4 PACS2-204ENST00000546915 576 ntTSL 423.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 135
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-212ENST00000492585 561 ntTSL 333.99■■■■□ 3.033e-7■■■■■ 134.2
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-207ENST00000479965 3102 ntTSL 225.37■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 130.6
DROSHAQ9NRR4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 130.6
DROSHAQ9NRR4 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 130.6
DROSHAQ9NRR4 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 130.6
DROSHAQ9NRR4 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 130.6
DROSHAQ9NRR4 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 329.68■■■□□ 2.342e-13■■■■■ 130.2
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-213ENST00000496568 839 ntTSL 236.69■■■■□ 3.463e-7■■■■■ 130.2
DROSHAQ9NRR4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.631e-11■■■■■ 129.3
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 527.69■■■□□ 2.021e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 526.69■■□□□ 1.861e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 525.71■■□□□ 1.711e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-16■■■■■ 128.6
DROSHAQ9NRR4 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.521e-323■■■■■ 128
DROSHAQ9NRR4 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.876e-33■■■■■ 127.5
DROSHAQ9NRR4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.111e-11■■■■■ 127.1
DROSHAQ9NRR4 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)37.61■■■■□ 3.611e-11■■■■■ 127.1
DROSHAQ9NRR4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.821e-11■■■■■ 127.1
DROSHAQ9NRR4 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 127.1
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-207ENST00000490262 450 ntTSL 218.46■□□□□ 0.551e-18■■■■■ 126.2
DROSHAQ9NRR4 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.011e-323■■■■■ 126
DROSHAQ9NRR4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.585e-7■■■■■ 124.4
DROSHAQ9NRR4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 124.4
DROSHAQ9NRR4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 124.4
DROSHAQ9NRR4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 124.4
DROSHAQ9NRR4 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.432e-16■■■■■ 124.3
DROSHAQ9NRR4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 RPP40-204ENST00000468105 632 ntTSL 222.04■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 RPP40-205ENST00000479782 500 ntTSL 521.63■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 124.2
DROSHAQ9NRR4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.52■■□□□ 1.22e-19■■■■■ 123.8
DROSHAQ9NRR4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 122.8
DROSHAQ9NRR4 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 122.8
DROSHAQ9NRR4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.151e-11■■■■■ 121.5
DROSHAQ9NRR4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.731e-11■■■■■ 121.5
DROSHAQ9NRR4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.11e-11■■■■■ 121.5
DROSHAQ9NRR4 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-11■■■■■ 121.5
DROSHAQ9NRR4 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-12■■■■■ 121
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.681e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 529.27■■■□□ 2.281e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 329.27■■■□□ 2.281e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 427.72■■■□□ 2.031e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.971e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 526.57■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 515.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 313.89□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 120.3
DROSHAQ9NRR4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.587e-12■■■■■ 118.8
DROSHAQ9NRR4 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.55□□□□□ -27e-21■■■■■ 117.3
DROSHAQ9NRR4 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC13.02□□□□□ -0.338e-30■■■■■ 116
DROSHAQ9NRR4 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.142e-8■■■■■ 115.9
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 223.93■■□□□ 1.428e-57■■■■■ 114.6
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