Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPRD1BQ9NQG5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPRD1BQ9NQG5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRD1BQ9NQG5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRD1BQ9NQG5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPRD1BQ9NQG5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPRD1BQ9NQG5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPRD1BQ9NQG5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPRD1BQ9NQG5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPRD1BQ9NQG5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPRD1BQ9NQG5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPRD1BQ9NQG5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPRD1BQ9NQG5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPRD1BQ9NQG5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1BQ9NQG5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1BQ9NQG5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1BQ9NQG5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1BQ9NQG5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1BQ9NQG5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1BQ9NQG5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPRD1BQ9NQG5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPRD1BQ9NQG5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1BQ9NQG5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1BQ9NQG5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPRD1BQ9NQG5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPRD1BQ9NQG5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPRD1BQ9NQG5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms