Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELL3Q9HB65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELL3Q9HB65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELL3Q9HB65 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ELL3Q9HB65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ELL3Q9HB65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ELL3Q9HB65 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELL3Q9HB65 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELL3Q9HB65 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELL3Q9HB65 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELL3Q9HB65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELL3Q9HB65 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL3Q9HB65 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELL3Q9HB65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELL3Q9HB65 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELL3Q9HB65 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL3Q9HB65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELL3Q9HB65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELL3Q9HB65 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms