Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4R4

NCOR1P1, Putative nuclear receptor corepressor 1-like protein NCOR1P1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1P1Q9H4R4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOR1P1Q9H4R4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCOR1P1Q9H4R4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOR1P1Q9H4R4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCOR1P1Q9H4R4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOR1P1Q9H4R4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCOR1P1Q9H4R4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOR1P1Q9H4R4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOR1P1Q9H4R4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCOR1P1Q9H4R4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCOR1P1Q9H4R4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOR1P1Q9H4R4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCOR1P1Q9H4R4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOR1P1Q9H4R4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOR1P1Q9H4R4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOR1P1Q9H4R4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOR1P1Q9H4R4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOR1P1Q9H4R4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOR1P1Q9H4R4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOR1P1Q9H4R4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOR1P1Q9H4R4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOR1P1Q9H4R4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOR1P1Q9H4R4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOR1P1Q9H4R4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOR1P1Q9H4R4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCOR1P1Q9H4R4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOR1P1Q9H4R4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCOR1P1Q9H4R4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOR1P1Q9H4R4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCOR1P1Q9H4R4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms