Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
HIRIP3Q9BW71 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
HIRIP3Q9BW71 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
HIRIP3Q9BW71 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HIRIP3Q9BW71 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HIRIP3Q9BW71 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
HIRIP3Q9BW71 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HIRIP3Q9BW71 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HIRIP3Q9BW71 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
HIRIP3Q9BW71 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
HIRIP3Q9BW71 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HIRIP3Q9BW71 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
HIRIP3Q9BW71 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HIRIP3Q9BW71 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
HIRIP3Q9BW71 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
HIRIP3Q9BW71 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HIRIP3Q9BW71 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HIRIP3Q9BW71 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
HIRIP3Q9BW71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HIRIP3Q9BW71 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
HIRIP3Q9BW71 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HIRIP3Q9BW71 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HIRIP3Q9BW71 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
HIRIP3Q9BW71 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
HIRIP3Q9BW71 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HIRIP3Q9BW71 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
HIRIP3Q9BW71 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
HIRIP3Q9BW71 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
HIRIP3Q9BW71 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HIRIP3Q9BW71 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HIRIP3Q9BW71 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
HIRIP3Q9BW71 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
HIRIP3Q9BW71 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
HIRIP3Q9BW71 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
HIRIP3Q9BW71 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
HIRIP3Q9BW71 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
HIRIP3Q9BW71 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HIRIP3Q9BW71 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HIRIP3Q9BW71 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HIRIP3Q9BW71 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HIRIP3Q9BW71 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
HIRIP3Q9BW71 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
HIRIP3Q9BW71 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
HIRIP3Q9BW71 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
HIRIP3Q9BW71 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
HIRIP3Q9BW71 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HIRIP3Q9BW71 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HIRIP3Q9BW71 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HIRIP3Q9BW71 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
HIRIP3Q9BW71 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HIRIP3Q9BW71 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
HIRIP3Q9BW71 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HIRIP3Q9BW71 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HIRIP3Q9BW71 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
HIRIP3Q9BW71 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
HIRIP3Q9BW71 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms