Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RUBCNQ92622 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RUBCNQ92622 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUBCNQ92622 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUBCNQ92622 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUBCNQ92622 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUBCNQ92622 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RUBCNQ92622 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUBCNQ92622 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUBCNQ92622 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUBCNQ92622 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUBCNQ92622 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUBCNQ92622 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUBCNQ92622 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUBCNQ92622 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUBCNQ92622 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUBCNQ92622 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms