Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGCLL1Q8TB92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGCLL1Q8TB92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGCLL1Q8TB92 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGCLL1Q8TB92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGCLL1Q8TB92 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGCLL1Q8TB92 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGCLL1Q8TB92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGCLL1Q8TB92 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGCLL1Q8TB92 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGCLL1Q8TB92 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGCLL1Q8TB92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGCLL1Q8TB92 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGCLL1Q8TB92 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGCLL1Q8TB92 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGCLL1Q8TB92 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMGCLL1Q8TB92 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCLL1Q8TB92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCLL1Q8TB92 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCLL1Q8TB92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGCLL1Q8TB92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCLL1Q8TB92 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCLL1Q8TB92 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGCLL1Q8TB92 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMGCLL1Q8TB92 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGCLL1Q8TB92 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCLL1Q8TB92 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCLL1Q8TB92 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCLL1Q8TB92 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCLL1Q8TB92 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCLL1Q8TB92 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HMGCLL1Q8TB92 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGCLL1Q8TB92 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGCLL1Q8TB92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGCLL1Q8TB92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGCLL1Q8TB92 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms