Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
C3orf20Q8ND61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
C3orf20Q8ND61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C3orf20Q8ND61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C3orf20Q8ND61 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
C3orf20Q8ND61 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C3orf20Q8ND61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C3orf20Q8ND61 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
C3orf20Q8ND61 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
C3orf20Q8ND61 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
C3orf20Q8ND61 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
C3orf20Q8ND61 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
C3orf20Q8ND61 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
C3orf20Q8ND61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
C3orf20Q8ND61 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
C3orf20Q8ND61 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
C3orf20Q8ND61 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
C3orf20Q8ND61 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
C3orf20Q8ND61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
C3orf20Q8ND61 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
C3orf20Q8ND61 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
C3orf20Q8ND61 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
C3orf20Q8ND61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
C3orf20Q8ND61 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
C3orf20Q8ND61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C3orf20Q8ND61 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
C3orf20Q8ND61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C3orf20Q8ND61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
C3orf20Q8ND61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C3orf20Q8ND61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C3orf20Q8ND61 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C3orf20Q8ND61 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C3orf20Q8ND61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C3orf20Q8ND61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C3orf20Q8ND61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
C3orf20Q8ND61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
C3orf20Q8ND61 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C3orf20Q8ND61 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C3orf20Q8ND61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C3orf20Q8ND61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C3orf20Q8ND61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C3orf20Q8ND61 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C3orf20Q8ND61 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms