Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NDUFAF2Q8N183 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NDUFAF2Q8N183 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NDUFAF2Q8N183 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NDUFAF2Q8N183 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NDUFAF2Q8N183 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NDUFAF2Q8N183 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NDUFAF2Q8N183 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NDUFAF2Q8N183 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NDUFAF2Q8N183 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NDUFAF2Q8N183 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NDUFAF2Q8N183 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NDUFAF2Q8N183 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NDUFAF2Q8N183 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NDUFAF2Q8N183 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NDUFAF2Q8N183 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NDUFAF2Q8N183 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFAF2Q8N183 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NDUFAF2Q8N183 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NDUFAF2Q8N183 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NDUFAF2Q8N183 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NDUFAF2Q8N183 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NDUFAF2Q8N183 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NDUFAF2Q8N183 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NDUFAF2Q8N183 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NDUFAF2Q8N183 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NDUFAF2Q8N183 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NDUFAF2Q8N183 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms