Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXM7

ODF3L1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L1Q8IXM7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF3L1Q8IXM7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF3L1Q8IXM7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF3L1Q8IXM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODF3L1Q8IXM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF3L1Q8IXM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODF3L1Q8IXM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF3L1Q8IXM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODF3L1Q8IXM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODF3L1Q8IXM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF3L1Q8IXM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF3L1Q8IXM7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF3L1Q8IXM7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF3L1Q8IXM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF3L1Q8IXM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF3L1Q8IXM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODF3L1Q8IXM7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF3L1Q8IXM7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF3L1Q8IXM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF3L1Q8IXM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF3L1Q8IXM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms