Protein–RNA interactions for Protein: Q53HV7

SMUG1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMUG1Q53HV7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMUG1Q53HV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMUG1Q53HV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMUG1Q53HV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMUG1Q53HV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMUG1Q53HV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMUG1Q53HV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMUG1Q53HV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMUG1Q53HV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMUG1Q53HV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMUG1Q53HV7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMUG1Q53HV7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMUG1Q53HV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMUG1Q53HV7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMUG1Q53HV7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMUG1Q53HV7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMUG1Q53HV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMUG1Q53HV7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMUG1Q53HV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMUG1Q53HV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMUG1Q53HV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMUG1Q53HV7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMUG1Q53HV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMUG1Q53HV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMUG1Q53HV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMUG1Q53HV7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMUG1Q53HV7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMUG1Q53HV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMUG1Q53HV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMUG1Q53HV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMUG1Q53HV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMUG1Q53HV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMUG1Q53HV7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMUG1Q53HV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMUG1Q53HV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMUG1Q53HV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMUG1Q53HV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMUG1Q53HV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMUG1Q53HV7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMUG1Q53HV7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMUG1Q53HV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMUG1Q53HV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMUG1Q53HV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMUG1Q53HV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMUG1Q53HV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms