Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA4

CR1L, Complement component receptor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1LQ2VPA4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CR1LQ2VPA4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CR1LQ2VPA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CR1LQ2VPA4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CR1LQ2VPA4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CR1LQ2VPA4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CR1LQ2VPA4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CR1LQ2VPA4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CR1LQ2VPA4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CR1LQ2VPA4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CR1LQ2VPA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CR1LQ2VPA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CR1LQ2VPA4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CR1LQ2VPA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CR1LQ2VPA4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CR1LQ2VPA4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CR1LQ2VPA4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CR1LQ2VPA4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CR1LQ2VPA4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CR1LQ2VPA4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CR1LQ2VPA4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CR1LQ2VPA4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CR1LQ2VPA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CR1LQ2VPA4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CR1LQ2VPA4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CR1LQ2VPA4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CR1LQ2VPA4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CR1LQ2VPA4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CR1LQ2VPA4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CR1LQ2VPA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CR1LQ2VPA4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CR1LQ2VPA4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CR1LQ2VPA4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CR1LQ2VPA4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CR1LQ2VPA4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CR1LQ2VPA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CR1LQ2VPA4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CR1LQ2VPA4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CR1LQ2VPA4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CR1LQ2VPA4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms