Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MICBQ29980 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICBQ29980 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICBQ29980 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICBQ29980 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICBQ29980 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICBQ29980 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MICBQ29980 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MICBQ29980 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MICBQ29980 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MICBQ29980 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MICBQ29980 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MICBQ29980 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MICBQ29980 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MICBQ29980 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MICBQ29980 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MICBQ29980 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MICBQ29980 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICBQ29980 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MICBQ29980 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MICBQ29980 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MICBQ29980 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MICBQ29980 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MICBQ29980 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MICBQ29980 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MICBQ29980 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MICBQ29980 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MICBQ29980 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MICBQ29980 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MICBQ29980 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MICBQ29980 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MICBQ29980 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MICBQ29980 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MICBQ29980 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MICBQ29980 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICBQ29980 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICBQ29980 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MICBQ29980 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICBQ29980 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICBQ29980 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICBQ29980 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICBQ29980 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICBQ29980 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICBQ29980 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MICBQ29980 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MICBQ29980 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MICBQ29980 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MICBQ29980 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MICBQ29980 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MICBQ29980 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MICBQ29980 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MICBQ29980 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MICBQ29980 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MICBQ29980 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MICBQ29980 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MICBQ29980 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MICBQ29980 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MICBQ29980 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MICBQ29980 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MICBQ29980 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MICBQ29980 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MICBQ29980 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MICBQ29980 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MICBQ29980 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MICBQ29980 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MICBQ29980 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MICBQ29980 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MICBQ29980 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MICBQ29980 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MICBQ29980 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MICBQ29980 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MICBQ29980 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MICBQ29980 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MICBQ29980 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MICBQ29980 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MICBQ29980 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MICBQ29980 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MICBQ29980 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MICBQ29980 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MICBQ29980 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MICBQ29980 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MICBQ29980 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MICBQ29980 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MICBQ29980 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MICBQ29980 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MICBQ29980 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MICBQ29980 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MICBQ29980 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MICBQ29980 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MICBQ29980 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MICBQ29980 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MICBQ29980 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MICBQ29980 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MICBQ29980 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MICBQ29980 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MICBQ29980 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MICBQ29980 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MICBQ29980 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MICBQ29980 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MICBQ29980 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms