Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKIDA1Q1XH10 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKIDA1Q1XH10 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKIDA1Q1XH10 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKIDA1Q1XH10 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKIDA1Q1XH10 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKIDA1Q1XH10 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SKIDA1Q1XH10 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SKIDA1Q1XH10 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SKIDA1Q1XH10 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SKIDA1Q1XH10 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SKIDA1Q1XH10 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SKIDA1Q1XH10 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SKIDA1Q1XH10 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKIDA1Q1XH10 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SKIDA1Q1XH10 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SKIDA1Q1XH10 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SKIDA1Q1XH10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SKIDA1Q1XH10 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SKIDA1Q1XH10 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SKIDA1Q1XH10 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SKIDA1Q1XH10 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SKIDA1Q1XH10 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SKIDA1Q1XH10 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SKIDA1Q1XH10 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SKIDA1Q1XH10 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SKIDA1Q1XH10 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SKIDA1Q1XH10 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SKIDA1Q1XH10 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKIDA1Q1XH10 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKIDA1Q1XH10 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKIDA1Q1XH10 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKIDA1Q1XH10 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms