Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2Q16385 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms