Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2Q16385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2Q16385 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2Q16385 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX2Q16385 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX2Q16385 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2Q16385 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2Q16385 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX2Q16385 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX2Q16385 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX2Q16385 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX2Q16385 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX2Q16385 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX2Q16385 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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