Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 MALRD1-201ENST00000377265 1761 ntTSL 26.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 30.5
HLTFQ14527 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 325.72■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-206ENST00000564992 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.72■□□□□ 0.755e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-203ENST00000563439 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.47■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.695e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-208ENST00000565645 519 ntTSL 417.97■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-207ENST00000565560 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.39■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-212ENST00000568199 613 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NOL3-210ENST00000568086 578 ntTSL 415.47■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LRRTM4-202ENST00000409093 2247 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.85e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 TPP2-204ENST00000482393 720 ntTSL 38.61□□□□□ -1.035e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.245e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 TPP2-203ENST00000466153 911 ntTSL 56.79□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.65e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 29.6
HLTFQ14527 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 520.5■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 318.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 LPCAT1-204ENST00000507282 417 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 49.83□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-212ENST00000568689 1998 ntTSL 330.88■■■□□ 2.532e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-209ENST00000567120 2205 ntTSL 1 (best)30.52■■■□□ 2.482e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 529.96■■■□□ 2.392e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.012e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-208ENST00000566199 719 ntTSL 326.08■■□□□ 1.772e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-213ENST00000569396 729 ntTSL 523.82■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-210ENST00000567901 785 ntTSL 321.43■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 STX18-AS1-203ENST00000507244 669 ntTSL 218.52■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-204ENST00000563088 1067 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 SERINC5-204ENST00000512972 1627 ntTSL 224.78■■□□□ 1.567e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 SERINC5-206ENST00000632581 1573 ntTSL 224.51■■□□□ 1.517e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.337e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.197e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 SERINC5-201ENST00000502747 2767 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.54□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 29.5
HLTFQ14527 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 526.22■■□□□ 1.797e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 520.51■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.657e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 MAP4-215ENST00000497735 2156 ntTSL 212.55□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 FBXL19-AS1-201ENST00000563777 3951 ntBASIC11.81□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.997e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 AC009120.2-201ENST00000620711 522 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -17e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 AC009120.2-202ENST00000566411 679 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -17e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 MAP4-203ENST00000383736 2282 ntTSL 58.34□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.18□□□□□ -1.267e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 EIF4G3-210ENST00000476088 406 ntTSL 52.82□□□□□ -1.967e-8■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 212.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 29.3
HLTFQ14527 ZNF518A-203ENST00000478086 1579 ntTSL 1 (best)4.53□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 29
HLTFQ14527 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ZCCHC11-214ENST00000484723 2910 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ZCCHC11-220ENST00000528642 3854 ntTSL 514.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 513.14□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 511.13□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 NPAS2-209ENST00000486017 764 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 ZCCHC11-203ENST00000371541 4319 ntTSL 25.94□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 NPAS2-211ENST00000492373 552 ntTSL 45.37□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 PLCB1-216ENST00000628239 830 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 PLCB1-205ENST00000437439 321 ntTSL 33.05□□□□□ -1.921e-7■■■■■ 28.4
HLTFQ14527 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 28.3
HLTFQ14527 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.271e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)25.16■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 DEF8-214ENST00000564379 2354 ntTSL 222.19■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 520.34■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 220.08■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 28.1
HLTFQ14527 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 520.07■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 28.1
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